这是一封30年前来自海峡对岸的信，信中写道：“四月初本人有缘参与贵校七十周年校庆及贵所新厦破土，殊以为幸，承蒙热烈欢迎，曷胜铭感。贵我两校今后在学术交流方面，希望早日展开，相互切磋，共谋进步，诚后生学子之幸也。”收信人时任厦门大学台湾研究所所长陈孔立，寄信人台湾淡江大学校长赵荣耀。寥寥百来字，承载着厦门大学乃至大陆对台交流的重要印迹。

信写于1991年7月20日，记录了淡江大学校长赵荣耀一行于当年4月参加厦门大学70周年校庆以及参加厦门大学台湾研究所大楼奠基仪式的历程，这是台湾地区高校代表团首次访问大陆高校。期间，淡江大学提出，为促进两校学术交流，希望与厦门大学结为姐妹学校。厦门大学当即请示国家教委，经批准后，双方签订了《厦门大学与淡江大学学术交流与合作意向书》。1995年4月，经过四年的等待，在厦门大学校领导赴台参加“两岸大学校长学术座谈会”期间，两校正式签署了《厦门大学与淡江大学学术交流协议书》。这是海峡两岸高校间第一个正式学术交流协议，开创了两岸校际交流合作的先河。然而，回顾过往，这一对台交流的重大成果来之不易。

20世纪50年代起，海峡两岸处于敌对状态，各方面交流全面中断。1979年元旦《告台湾同胞书》发表，揭开两岸关系的新篇章，两岸学术交流的大门随之缓缓开启，地处海峡西岸的厦门大学率先开始与台湾学术界的接触与交流。

1988年，台湾报纸以“陈孔立文到人不到，台海学术首开交流”为题，报道了陈孔立赴台参会，却因限制未能入台，论文由台湾史研究会理事长王晓波代为宣读的情形。陈孔立因此被称为“大陆敲门去台湾的第一学者”。同年8月，王晓波率近30位台湾学者以“个人探亲”的名义到访厦门大学。两岸间的学术交流在曲折中发展着。

1992年之后，厦门大学学者开始陆续赴台开展学术交流，备受瞩目。1992年6月，厦门大学五位学者赴台参加学术研讨会，台湾媒体报道称“大陆首批大规模的人文及社会科学家来访”。同年11月，厦门大学四位研究台湾问题的学者赴台进行学术访问，这是大陆研究台湾问题的学者首度组团赴台，反响强烈。

近年来，在国家大力支持和推动下，厦门大学对台交流广度、深度都有了新的发展和突破。2020年1月15日，厦门大学与台湾海洋大学续签校级框架合作协议，12月，两校以视频会议的方式召开海洋科教合作平台第一次联席会议，两校校长及相关领域专家学者与会，双方就推动两校海洋科教合作具体事项进行深入探讨交流，达成多项共识。目前,厦门大学已经和台湾33所院校开展校际合作，截至2019年，平均每年有近千名师生赴台开展教师互访、学生互派、科研合作、学术会议等实质性合作，形成了“山海论坛”“海峡两岸大学生闽南文化研习夏令营”“两岸学子论坛”等一批独具特色的品牌活动，成为两岸交流的前沿重镇和重要平台。