中共厦门大学第九次代表大会于2007年9月27日至9月28日召开。大会正式代表253名，代表全校7996名党员。

朱崇实主持大会。朱之文作《坚持科学发展 构建和谐校园 为建设世界知名高水平研究型大学而努力奋斗》报告。魏洪沼作《全面履行党章赋予的职责和任务 扎实推进党风廉政建设和反腐败工作》报告。

大会提出了今后一个时期学校工作的指导思想，即：高举中国特色社会主义伟大旗帜，以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，深入贯彻落实科学发展观，转变发展观念，创新发展模式，破解发展难题，推动科学发展，促进校园和谐，加快建设世界知名高水平研究型大学，为全面建设小康社会、建设创新型国家和实现祖国统一大业做出更大的贡献。大会提出了“各项事业又好又快发展，初步建成世界知名的高水平研究型大学”的奋斗目标，强调了推动发展的六个原则。围绕这个目标，基于这个原则，对教学、科研、社会服务、人才队伍建设、学科建设、服务祖国统一大业、国际交流合作、办学条件、学校管理等主要任务作出了全面部署。大会强调要加强和改进党的领导，对贯彻落实保持共产党员先进性长效机制，全面加强学校党的建设和思想政治工作作了部署。

中共厦门大学第十次代表大会于2013年6月18日至6月19日召开。大会正式代表277名，代表全校11549名党员。

大会的主题是：高举中国特色社会主义伟大旗帜，以邓小平理论、“三个代表”重要思想、科学发展观为指导，深入贯彻落实党的十八大精神，团结动员全校党员和师生员工，解放思想，改革创新，坚定自信，奋勇争先，为全面建成世界知名高水平研究型大学而奋斗。

朱崇实主持大会。杨振斌作《解放思想改革创新坚定自信奋勇争先为全面建成世界知名高水平研究型大学而奋斗》报告。提出了今后五年乃至更长一段时期，学校发展的战略总目标：经过三个阶段的努力，在建校一百年时全面建成世界知名高水平研究型大学，力争在新中国成立一百年时跻身世界一流大学行列。

大会号召，全校各级党组织、全体共产党员和广大师生员工，认真学习贯彻本次党代会精神，秉承“自强不息、止于至善”的校训，解放思想，改革创新，坚定自信，奋勇争先，坚定不移地朝着全面建成世界知名高水平研究型大学、力争跻身世界一流大学行列的目标奋勇前进，为实现国家富强、民族振兴、人民幸福的伟大中国梦作出新的更大贡献。

中共厦门大学第十一次代表大会于2018年6月28日至6月29日召开。大会应到代表278名，实到代表257名，代表全校13058名党员。

大会主题是：高举中国特色社会主义伟大旗帜，深入学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想和党的十九大精神，以立德树人为根本，以改革创新为动力，牢记历史使命，扎根中国大地，加快“双一流”建设，推进内涵式发展，坚定不移为全面实现“百年厦大”建设目标、加快建设中国特色世界一流大学而奋勇前进。

张荣主持大会。张彦作《奋进新时代 筑梦新征程 为加快建设中国特色世界一流大学而不懈奋斗》报告。报告提出我校进一步深化创建世界一流大学的“三步走”战略：第一步，到建校百年之际，全面建成世界知名高水平研究型大学。部分学科达到世界一流水平，人才培养质量和创新能力显著增强，产出一批高显示度原创性成果，全面提升服务国家现代化建设的能力。第二步，到2035年左右，跻身世界一流大学行列。学科整体实力显著提升，若干学科进入世界一流前列，人才培养、科学研究、社会服务能力全面增强，学校办学声誉和办学水平获得国际公认，为国家现代化建设作出突出贡献。第三步，到新中国成立百年之际，跃居世界一流大学前列。一批学科进入世界一流前列，为实现社会主义现代化强国目标、为人类文明进步作出卓越贡献。

大会号召，全校各级党组织、全体共产党员和广大师生员工要更加紧密地团结在以习近平同志为核心的党中央周围，认真学习和贯彻本次党代会精神，不忘初心、牢记使命，艰苦奋斗、锐意进取，以时不我待、只争朝夕的精神，以新担当新作为不断开创世界一流大学建设的新局面，为实现中华民族伟大复兴的中国梦不断作出厦门大学新的时代贡献。